Odborné textyRepetitorium - klinická genetikaRepetitorium - biochemie obecná

MS matrice MALDI

JVAXD

Matrice pro ionizace v hmotnostní spektrometrii

 

Existuje celá řada molekul, které mohou být ionizovány po nanesení na příslušnou matrici. Některé z těchto matric, např. 2,5-dihydroxybenzoová kyselina (DHB), jsou vhodné k širokému použití. Některé příklady jsou uvedeny v tabulce:

 

Matrice

Zkratka

Molekulová hmotnost

Rozpouštědlo

Aplikace

3-amino-4-hydroxybenzoová kyselina

-

153,1

MeCN/H2O

Cukry

2,5-dihydroxybenzoová kyselina

DHB

154,1

MeCN, aceton

Obecné, zvláště cukry

DHB/2-hydroxy-5-methoxybenzová kyselina

Super-DHB

154,1/168,1

MeCN, aceton

Peptidy, cukry

DHB/1-hydroxy-iso-chinolin

DHB/HIQ

154,1/145,2

MeCN/H2O

Cukry

2-(4´-hydroxy-fenylazo)benzoová kyselina

HABA

242,2

aceton

Polymery, cukry

Kyselina skořicová

-

148,1

MeCN/H2O

Univerzální

Kyselina nikotinová

-

123,1

H2O

Proteiny

Kyselina sinapová (3,5-dimethoxy-4-hydroxy)skořicová kyselina

-

224,2

MeCN/H2O

Proteiny, polymery

Alfa-kyano-4-hydroxyskořicová kyselina

4-HCCA

189,2

MeCN/H2O,

aceton

Peptidy, lipidy

2,4,6-trihydroxyacetofenon

THAP

167,2

etanol

Cukry, zejména s obsahem sialové kyseliny, oligonukleotidy

Arabinoosazon

-

328,4

Etanol, metanol

Cukry

 

S vývojem techniky MALDI se profilovaly i jednotlivé typy matric vhodných pro určitý okruh analyzovaných látek. Pro uspokojivé použití by matrice měla splňovat následující vlastnosti:

·         Schopnost tvořit krystaly začleňující analyt do své krystalové mřížky nebo schopnost pojmout analyt, je-li matricí kapalina

·         Schopnost absorbovat energii laseru

·         Dostatečnou těkavost k převodu do hmotového spektrometru

·         Vhodné chemické vlastnosti pro ionizaci

 

Většinu dříve používaných matric tvořily malé organické kyseliny schopné protonovat proteiny a aminokyseliny, které byly cílem použití této techniky. V současnosti je používána i řada neutrálních a dokonce i bazických sloučenin. Smíchání matrice se vzorkem může nastat před nanesením na nosič, častěji jsou však roztoky vzorku a matrice naneseny na podložku nezávisle a teprve zde dochází k promíchání. U řady vzorků dochází k vysušení vlivem okolních podmínek, sušení může být urychleno teplem, proudem vzduchu nebo inertního plynu, nebo umístěním podložky do exsikátoru. Tyto postupy vyhovují většině analyzovaných sloučenin, mají však také řadu variant zohledňujících vlastnosti analytu a směřujících zejména k maximální síle a kvalitě signálu. Může se například stát, že malé krystaly matrice z originální vrstvy mohou katalyzovat vznik dalších malých krystalů ve finálním spotu.

Některé matrice (např. 2,5-dihydroxybenzoová kyselina, DHB) produkují jen malé množství velkých krystalů, obvykle na periferii daného terčíku směřujících dovnitř, takže při použití instrumentace bez vybavení kamerou může být složité nalézt vhodný bod k získání signálu.

Někdy mohou být použita aditiva tvořící iontový pár se vzorkem nebo s nečistotou matrice (např. použití kyseliny citronové k vazbě interferujících kationtů v hydroxybenzofenonové matrici).

 

Čistota vzorku je důležitým faktorem pro získání kvalitního MALDI spektra. Kontaminanty jako jsou soli a pufry inhibují krystalizaci vzorku na nosiči. Mezi mikročistící postupy patří kapková dialýza, při které se kapička vzorku (okolo 1 µl) čistí přes dialyzační membránu plovoucí na povrchu vody. Variantami tohoto postupu může být použití membrány absorbující hydrofóbní sloučeniny, nebo použití iontoměničové pryskyřice, či fáze C18 (mikrokolonka jako součást pipetovací špičky). Jiné odsolovací postupy postupy využívají přímo iontoměnič jako součást MALDI terčíku, částečky jsou mechanicky odstraněny ještě před vstupem do hmotového spektrometru.

 

Další informace

 

 

Literatura:

  • Farmer TB and Caprioli RM (1998) Determination of protein-protein interactions by matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry. Journal of Mass Spectrometry 33: 697-704.
  • Harvey DJ (1999) Matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry of carbohydrates. Mass Spectrometry Reviews 18: 349-451.
  • Jackson AT, Yates HT, Scrivens JH, Green MR, and Bate-man RH (1998) Matrix-assisted laser desorption/ioniza-tion-collision induced dissociation of polystyrene. Journal of the American Society for Mass Spectrometry 9:269-274.
  • Merchant M and Weinberger SR (2000) Recent advancements in surface-enhanced laser desorption/ionization-time of flight-mass spectrometry. Electrophoresis 21: 1164-1167.
  • Montaudo G and Lattimer RP (eds.) (2002) Mass Spectrometry of Polymers. Boca Raton, FL: CRC Press.
  • Parees DM, Hanton SD, Cornelio Clark PA, and Willcox DA (1998) Comparison of mass spectro-metric techniques for generating molecular weight information on a class of ethoxylated ohgomers. Journal of the American Society for Mass Spectrometry 9: 282-291.
  • Tang N, Tornatore P, and Weinberger SR (2004) Current developments in SELDI affinity technology. Mass Spectrometry Reviews 23: 24-44.
  • Zhu H, Yalcin T, and Liang L (1998) Analysis of the accuracy of determining average molecular weights of narrow polydispersity polymers by matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry. Journal of the American Society for Mass Spectrometry 9: 275-281.

 

 Jaroslava Vávrová