Serinové
proteázy jsou
nejlépe prostudovanou mechanistickou třídou proteolytických enzymů. Při štěpení
bílkovin využívají hydroxylu serinového rezidua k nukleofilní atace peptidové
vazby. Z praktických důvodů je několik známých threoninových proteáz rovněž
přiřazeno k této skupině. Serinové proteázy účinkují ve slabě alkalickém
prostředí, nevyžadují žádné kofaktory, kalciové ionty však některé enzymy
stabilizují a mohou se účastnit aktivačních reakcí. Jsou syntetizovány jako
větší inaktivní prekurzory, zymogeny, a k jejich proteolytické aktivaci
dochází mimo buňky. Prvním stadiem štěpení peptidové vazby je vytvoření
kovalentního acylenzymového meziproduktu, ve kterém karboxylová
komponenta substrátu vytváří ester s hydroxylem katalytického serinu za
současného odštěpení C-koncového peptidu. Ve druhé fázi je pak tento
intermediát hydrolyzován molekulou vody, takže dojde k uvolnění i druhého,
N-koncového peptidu. Serinové proteázy jsou rozčleněny podle příbuznosti
aminokyselinových sekvencí na 40 rodin, podle podobnosti prostorových struktur
na 7 klanů. Biomedicínsky relevantní serinové proteázy jsou uvedeny
v následující tabulce.
|
Rodina |
Klan |
Reprezentativní proteázy |
|
Trypsinová
rodina |
SA |
trypsin,
chymotrypsin, pankreatická elastáza, leukocytární elastáza, enteropeptidáza,
katepsin G, myeloblastin, chymáza, tryptáza, granzymy, akrosin |
|
Kalikreinová
rodina a příbuzné proteázy |
SA |
tkáňový
a plazmatický kalikrein, semenoželáza (PSA), složky komplementu (faktor D, B,
I, komponenty C1r, C1s, C2, konvertázy C3/C5 dráhy), serinová endopeptidáza
sdružená s manosu vázajícím proteinem, koagulační faktory (VIIa, IXa, X,
XIa, XIIa), thrombin, protein C, aktivátoři plasminogenu (uPA, tPA), plasmin,
hepsin, prostasin, hepatocyte growth factor activator, guanidinobenzoatáza |
|
Subtilisinová
rodina |
SB |
tripeptidylpeptidáza
II, furin, proproteinkonvertázy (1, 2, 4, 5, PACE4, PC7) |
|
Proteázy
obsahující ve struktuře „alfa/beta
hydrolase fold“ |
SC |
prolyloligopeptidáza,
dipeptidylpeptidázy (II, IV), acylaminoacylpeptidáza, fibroblastový aktivační
protein, karboxypeptidázy (A, C, D, Pro-X, Y) |
|
Signální
peptidázy |
SF |
signální
peptidázy (mikrosomální, mitochondriální) |
|
N-terminální
nukleofilní peptidázy |
TA |
proteasom
(20S, 26S), gama-glutamyltranspeptidáza |
|
Nezařazené
peptidázy |
|
mitochondriální
peptidázy (Clp, La) dipeptidylpeptidáza
III, tripeptidylpeptidáza I |
Další
informace
Proteiny systému proteáz a
antiproteáz
Jaromír Kotyza