Struktura vytvořená
interakcí skupin vázaných na hlavním řetězci polypeptidů. Tyto interakce určují
celkový tvar a způsob zohýbání polypeptidové šroubovice.
Myoglobin a hemoglobin mají terciární
strukturu, která byla stanovena rentgenovou analýzou. Při utváření této
struktury se uplatňují například van der Waalsovy síly a kovalentní vazby
S−S.