Apolipoprotein(a) se nachází na povrchu lipoproteinu(a).
Je to glykoprotein, obsahující asi 30 váhových procent sacharidů a
polypeptidový řetězec o velikosti 300-800 kD. Gen kódující apo(a) se nachází na
dlouhém raménku 6. chromosomu poblíž genu pro plazminogen. Je to protein vysoce
polymorfní, nejevící žádnou nápadnou podobnost s jiným apolipoproteinem. Jeho
základní jednotkou je tzv. “kringle” (“smyčka“), struktura velmi častá právě u
proteinů známých z procesu fibrinolýzy. Jedná se o proteinovou doménu
obsahující asi 80 aminokyselinových zbytků, vzájemně spojených třemi vnitřními
disulfidickými můstky. Molekulová váha apolipoproteinu apo(a) se může u jeho
četných polymorfních variant lišit a je dána právě počtem “kringlů”. Apo(a) s
obsahem 17 až více než 30 “kringlů” se velmi podobá Glu-plazminogenu
(plazminogen s kyselinou glutamovou vázanou na N-terminálním konci).
Strukturní homologie apo(a) s proenzymem fibrinolytického systému
plazminogenem spočívá zejména v tom, že má stejnou proteázovou oblast
a podobné, ne však shodné domény tvaru složených smyček “kringle 4“ a “kringle
5“. Na rozdíl od plazminogenu ale apo(a) nemá “kringle 1-3“ a navíc se “kringle
4“ v apo(a) vyskytuje v mnoha tandemových kopiích. Proteázová doména
apoproteinu(a) se z 94 % podobá proteázové doméně plazminogenu, na rozdíl
od ní je však v proteázové doméně apoproteinu(a) zaměněn serin za arginin.
Tato záměna vede k tomu, že na rozdíl od plazminogenu lipoprotein(a) plazmin
neaktivuje.
Další informace:
.