„Malé“
inhibitory serinových proteáz tvoří relativně malé proteiny (29 až 180 aminokyselinových
zbytků), z nichž většina má společný strukturní rys: vyčnívající vazebnou
smyčku (binding loop) kanonické
konformace. Enzym s touto smyčkou reaguje podobně jako se
substrátem, je vytvořen komplex mezi enzymem a inhibitorem, aminokyseliny
aktivního místa jsou však s rigidním inhibitorem v tak úzkém
kontaktu, že ztrácejí schopnost flexibilního přizpůsobení, které je podmínkou
štěpení peptidové vazby. Poněkud odlišný je reakční mechanismus malých
nekanonických inhibitorů (např. hirudinu).
|
Rodina |
Příklady/synonyma |
Mr (kDa) |
|
BPTI
(Kunitz, Kunin) |
hovězí pankreatický
trypsinový inhibitor (BPTI, aprotinin, Trasylol) inhibitorová
doména b-amyloidového prekurzorového proteinu (Alzheimerova ch.) |
6.5 |
|
Kazal |
trypsinový
inhibitor vaječného bílku (ovomucoid) lidský
pankreatický sekreční trypsinový inhibitor |
27 |
|
Potato-Inhibitor-1 |
eglin C
z pijavek |
app.7 |
|
Bowman-Birk |
trypsin/chymotrypsinový
Bowman-Birkův inhibitor |
9 |
|
Soybean
trypsin inhibitor – Kunitz |
trypsinový
inhibitor ze sojových bobů (STI, SBTI) |
20.1 |
|
Streptomyces
subtilisin inhibitor |
streptomycetový
subtilisinový inhibitor (SSI) |
|
|
Chelonianin |
sekreční
leukocytový proteinázový inhibitor (SLPI) elafin |
12 6 |
|
Hirudin |
hirudin
z pijavek |
7 |
Další
informace
Proteiny systému proteáz a
antiproteáz
Jaromír Kotyza