Odborné textyRepetitorium - klinická genetikaRepetitorium - biochemie obecná

Aminokyseliny: vlastnosti

AJDOS

Vlastnosti aminokyselin lze rozdělit na fyzikální, chemické a biologické. Fyzikální vlastnosti postranních řetězců aminokyselin (velikost, polarita, acidobazický charakter, optické vlastnosti) mají pro formování konformace peptidů a bílkovin větší význam než chemická povaha postranních řetězců.

 

Fyzikální vlastnosti aminokyselin

 

Polarita

 

typ postranního řetězce

aminokyseliny

poznámky

nepolární (hydrofobní)

 Alanin

 Valin

 Leucin

 Izoleucin

 Prolin

 Fenylalanin

a do značné míry také

 Tryptofan

 Methionin

Jsou ve vodě méně rozpustné než ostatní aminokyseliny, jejich postranní řetězce se uplatňují v hydrofobních interakcích bílkovin.

polární, který nemá v neutrálním prostředí elektrický náboj

 Serin

 Treonin

 Cystein

 Tyrozin

 Asparagin

 Glutamin

Polární postranní řetězec může vytvářet vodíkové vazby.

polární, který má v neutrálním prostředí elektrický náboj

 Aspartát

 Glutamát

 Histidin

 Lysin

 Arginin

Polární postranní řetězec se podílí na elektrostatických interakcích.

bez postranního řetězce

 Glycin

 

 

Acidobazický charakter

 

Výraznou vlastností aminokyselin je dipolární charakter jejich molekul – v závislosti na pH prostředí se mohou chovat jako kyseliny i jako zásady, jsou to látky amfoterní neboli amfolyty. Jednotlivá molekula aminokyselin v roztoku existuje pouze v jedné z možných forem (bez náboje ne):

H3N+ CH(R) COOH

H3N+ CH(R) COO- (dipolární forma)

H2N CH(R) COO-

 

Polární charakter aminokyselin je příčinou jejich vysokého bodu tání, nerozpustnosti v nepolárních rozpouštědlech a rozpustnosti ve vodě. Rovnováha v roztoku je závislá na disociačních konstantách skupin -COOH, -NH2 a na pH roztoku.

 

KEY-SIzoelektrický bodKEY-E  (pI) odpovídá hodnotě pH, při které v roztoku převládá dipolární forma aminokyseliny, dipolární ion při pH = pI v elektrickém poli nemigruje.

        

        pK1 + pK2

pI  = --------------

               2                              

K1, K2… kyselé disociační konstanty

aminokyselina

symbol

kyselá disociační konstanta

pK = -log K

izoelektrický bod

pI

 Glycin

Gly

2,34; 9,60

5,97

 Alanin

Ala

2,34; 9,69

6,01

 Valin

Val

2,32; 9,62

5,97

 Leucin

Leu

2,36; 9,60

5,98

 Izoleucin

Ile

2,26; 9,62

6,02

 Serin

Ser

2,21; 9,15

5,68

 Treonin

Thr

2,15; 9,12

5,64

 Cystein

Cys

1,71; 8,33 (SH); 10,78

5,02

 Methionin

Met

2,28; 9,21

5,74

 Aspartát

Asp

2,09; 3,86 (beta-COOH); 9,82

2,98

 Glutamát

Glu

2,19; 4,25 (gama-COOH); 9,67

3,22

 Asparagin

Asn

2,02; 8,80

5,41

 Glutamin

Gln

2,17; 9,13

5,65

 Lysin

Lys

2,20; 8,90; 10,28 (epsilon-NH3+)

9,59

 Arginin

Arg

2,17; 9,04; 12,48 (Gua+)

10,76

 Histidin

His

1,82; 6,0 (Im+); 9,17

7,59

 Fenylalanin

Phe

1,83; 9,13

5,48

 Tyrozin

Tyr

2,20; 10,07 (OH); 9,11

5,66

 Tryptofan

Trp

2,38; 9,39

5,89

 Prolin

Pro

1,99; 10,60

6,40

 

 

Chemické vlastnosti alfa-aminokyselin

 

Obecné chemické vlastnosti alfa-aminokyselin vyplývají ze společné struktury na jejich alfa-uhlíkovém atomu. Karboxylová skupina může vytvářet funkční deriváty reakcí s nukleofilními činidly, uplatňuje se zejména tvorba amidů, esterů. Aminoskupina vytváří karboxamidy reakcí s oxidem uhličitým, acylamidy reakcí s kyselinami a Schiffovy báze reakcí s karbonylovými sloučeninami.

 

Všechny tyto reakce se uplatňují při biochemických přeměnách aminokyselin v organismu i v mechanismu funkce bílkovin.

 


Reakcí dvou aminokyselin, při níž reaguje alfa-aminoskupina jedné aminokyseliny s alfa-karboxylovou skupinou druhé, vzniká dipeptid. Vazba, kterou jsou zbytky aminokyselin spojeny, se nazývá  KEY-Speptidová vazbaKEY-E . Tato vazba se v silně kyselém i zásaditém prostředí snadno hydrolyticky štěpí, v neutrálním prostředí je stálá.

Rozlišují se oligopeptidy (do 10 aminokyselinových zbytků), polypeptidy (11-100 aminokyselinových zbytků). Peptidové řetězce obsahující více než 100 aminokyselinových zbytků tvoří základ bílkovin.

 

Dělení aminokyselin

 

alifatické

 Glycin

 Alanin

 Valin

 Leucin

 Izoleucin

 Serin

 Treonin

 

aromatické

 Fenylalanin

 Tyrozin

 Tryptofan

spojují se van der Waalsovými vazbami s jinými aromatickými sloučeninami

aromatické kruhy fungují jako chromofory a absorbují UV záření v oblasti vlnových délek 260 - 300 nm

kyselé (aminodikarboxylové)

 Aspartát

 Glutamát

při pH = 7 jsou negativně nabité

mohou elektrostaticky vázat kationty a vytvářet solné můstky s kladně nabitými skupinami

mohou kovalentně vázat aminy, alkoholy, oxid uhličitý

bazické (diaminomonokarboxylové)

 Lysin

 Arginin

 Histidin (slabě)

při pH = 7 jsou pozitivně nabité

představují protipól kyselých funkčních skupin pro tvorbu solných můstků a vazbu aniontů

mohou kovalentně vázat karbonylové skupiny formou Schiffových bazí

 

Biologické vlastnosti aminokyselin

 

Kromě kódovaných aminokyselin má mnoho dalších aminokyselin biologický význam. Mohou to být nejen alfa-, ale i beta-, gama- nebo delta-aminokyseliny. Např. beta-alanin je prekurzorem vitaminu pantotenové kyseliny a součástí některých peptidů (anserinu, karnozinu, aj.). Gama-aminobutyrát je inhibitor přenosu informací mezi nervovými buňkami. Různě substituované přírodní aminokyseliny jsou např. ornitin, citrulin – významné meziprodukty močovinovinového cyklu.

 

Karolína Pešková