Komparativní
genomová hybridizace (CGH) je molekulární cytogenetická metoda, která umožňuje detekovat a mapovat
relativní počet kopií jednotlivých sekvencí mezi různými genomy.
Tento postup byl popsán Kallioniemim a kol. v roce 1992. Normální a studovaná DNA jsou odlišně označeny některými z haptenů a jsou
simultáně kohybridizovány na preparát s normálními chromosomy
v metafázi. Oblasti zmnožení nebo ztráty DNA sekvencí jako jsou delece,
duplikace nebo amplifikace jsou zvýrazněny rozdílnou barvou homologů. To je
způsobeno změnou poměru intenzity
signálu obou fluorochromů, signál je měřen podél
cílových, normálních chromosomů. Poměr intenzit signálů je zpracován nejméně u
10 mitóz pomocí počítačového programu, který určí místa příslušné změny ve
smyslu delece nebo amplifikace. CGH detekuje změny, které jsou přítomny ve
většině nádorových buněk (t.j. klonální aberace). Má vysokou vypovídací hodnotu
pro komplexní změny karyotypu a pro lokalizaci marker chromosomů, amplifikaci
genů ve formě tzv. double minutes a homogenně se barvících oblasti. CGH nelze
využít u jednoduchých translokací, inverzí a inzercí, při kterých se nemění
poměr počtu kopií sekvencí DNA.
Na stejném
principu jako CGH je založena metoda mikročipů a tzv. matrix CGH.
Další informace
·
Cytogenetika:
klasické metody
·
Klinická
genetika: základní pojmy
·
Metody
molekulárně genetické
·
Hybridizace
komparativní genomová: matrix CGH
Kyra Michalová
.