Enzymy: (EC 6.3.x.x) Tvořící C-N vazby

EC 6.3.1.x Kyselina—amonio (nebo amid) ligázy (amid syntázy)

EC označení

Český název

Oficiální IUPAC název

Katalyzovaná reakce

EC 6.3.1.1 

Aspartát—amonio ligáza

aspartate—ammonia ligase

ATP + L-aspartát + NH₃ = AMP + difosfát + L-asparagin

EC 6.3.1.2 

Glutamát—amonio ligáza

glutamate—ammonia ligase

ATP + L-glutamát + NH₃ = ADP + fosfát + L-glutamin

EC 6.3.1.3 

Překlasifikován na: EC 6.3.4.13.

EC 6.3.1.4 

Aspartát—amonio ligáza (tvořící ADP)

aspartate—ammonia ligase (ADP-forming)

ATP + L-aspartát + NH₃ = ADP + fosfát + L-asparagin

EC 6.3.1.5 

NAD(+) syntáza

NAD+ synthase

ATP + deamido-NAD⁺ + NH₃ = AMP + difosfát + NAD⁺

EC 6.3.1.6 

Glutamát—etylamin ligáza

glutamate—ethylamine ligase

ATP + L-glutamát + ethylamin = ADP + fosfát + N⁵-ethyl-L-glutamin

EC 6.3.1.7 

4-metylenglutamát—amonio ligáza

4-methyleneglutamate—ammonia ligase

ATP + 4-methylen-L-glutamát + NH₃ = AMP + difosfát + 4-methylen-L-glutamin

EC 6.3.1.8 

Glutathionylspermidin syntáza

glutathionylspermidine synthase

glutathion + spermidin + ATP = glutathionylspermidin + ADP + fosfát

EC 6.3.1.9 

Trypanothion syntáza

trypanothione synthase

glutathion + glutathionylspermidin + ATP = N¹,N⁸-bis(glutathionyl)spermidin + ADP + fosfát

EC 6.3.1.10 

Adenosylkobinamid-fosfát syntáza

adenosylcobinamide-phosphate synthase

(1) ATP + adenosylkobyrová kyselina + (R)-1-aminopropan-2-yl fosfát = ADP + fosfát + adenosylkobinamid fosfát

(2) ATP + adenosylkobyrová kyselina + (R)-1-aminopropan-2-ol = ADP + fosfát + adenosylkobinamid

EC 6.3.1.11 

Glutamát—putrescin ligáza

glutamate—putrescine ligase

ATP + L-glutamát + putrescin = ADP + fosfát + γ-L-glutamylputrescin

EC 6.3.1.12

D-aspartát ligáza

D-aspartate ligase

ATP + D-aspartát + [β-GlcNAc-(1→4)-Mur2Ac(oyl-L-Ala-γ-D-Glu-L-Lys-D-Ala-D-Ala)]_n = [β-GlcNAc-(1→4)-Mur2Ac(oyl-L-Ala-γ-D-Glu-6-N-(β-D-Asp)-L-Lys-D-Ala-D-Ala)]_n + ADP + fosfát

EC 6.3.2.x Kyselina—D-aminokyselina ligázy (peptid syntázy)

EC označení

Český název

Oficiální IUPAC název

Katalyzovaná reakce

EC 6.3.2.1 

Pantoát—beta-alanin ligáza

pantoate—β-alanine ligase

ATP + (R)-pantoát + β-alanin = AMP + difosfát + (R)-pantothenát

EC 6.3.2.2 

Glutamát-cystein ligáza

glutamate—cysteine ligase

ATP + L-glutamát + L-cystein = ADP + fosfát + γ-L-glutamyl-L-cystein

EC 6.3.2.3 

Glutathionsyntáza

glutathione synthase

ATP + γ-L-glutamyl-L-cystein + glycin = ADP + fosfát + glutathion

EC 6.3.2.4 

D-alanin—D-alanin ligáza

D-alanine—D-alanine ligase

ATP + 2 D-alanin = ADP + fosfát + D-alanyl-D-alanin

EC 6.3.2.5 

Fosfopantothenát—cystein ligáza

phosphopantothenate—cysteine ligase

CTP + (R)-4'-fosfopantothenát + L-cystein = CMP + difosfát + N-[(R)-4'-fosfopantothenoyl]-L-cystein

EC 6.3.2.6 

Fosforibosylaminoimidazolsukcinokarboxamid syntáza

ATP + 5-amino-1-(5-fosfo-D-ribosyl)imidazol-4-karboxylát + L-aspartát = ADP + fosfát + (S)-2-[5-amino-1-(5-fosfo-D-ribosyl)imidazol-4-karboxamido]sukcinát

phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide synthase

EC 6.3.2.7 

UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamát—L-lysin ligáza

UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate—L-lysine ligase

ATP + UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamát + L-lysin = ADP + fosfát + UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamyl-L-lysin

EC 6.3.2.8 

UDP-N-acetylmuramát—L-alanin ligáza

UDP-N-acetylmuramate—L-alanine ligase

ATP + UDP-N-acetylmuramát + L-alanin = ADP + fosfát + UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanin

EC 6.3.2.9 

UDP-N-acetylmuramoylalanin—D-glutamát ligáza

UDP-N-acetylmuramoylalanine—D-glutamate ligase

ATP + UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanin + D-glutamát = ADP + fosfát + UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamát

EC 6.3.2.10 

UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptid—D-alanyl-D-alanin ligáza

UDP-N-acetylmuramoylalanyl-tripeptide—D-alanyl-D-alanine ligase

ATP + UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-γ-D-glutamyl-L-lysin + D-alanyl-D-alanin = ADP + fosfát + UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-γ-D-glutamyl-L-lysyl-D-alanyl-D-alanin

EC 6.3.2.11 

Karnosin syntáza

carnosine synthase

ATP + L-histidin + β-alanin = AMP + difosfát + karnosin

EC 6.3.2.12 

Dihydrofolát syntáza

dihydrofolate synthase

ATP + 7,8-dihydropteroát + L-glutamát = ADP + fosfát + 7,8-dihydropteroylglutamát

EC 6.3.2.13 

UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamát—2,6-diaminopimelát ligáza

UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate—2,6-diamino-pimelate ligase

ATP + UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamát + meso-2,6-diaminoheptanedioát = ADP + fosfát + UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-γ-glutamyl-meso-2,6-diamino-heptanedioat

EC 6.3.2.14 

2,3-dihydroxybenzoát—serin ligáza

2,3-dihydroxybenzoate—serine ligase

ATP + 2,3-dihydroxybenzoát + L-serin = produkty ATP rozkladu + N-(2,3-dihydroxybenzoyl)-L-serin

EC 6.3.2.15 

Překlasifikován na: EC 6.3.2.10

EC 6.3.2.16 

D-alanin—alanyl-poly(glycerolfosfát) ligáza

D-alanine—alanyl-poly(glycerolphosphate) ligase

ATP + D-alanin + alanyl-poly(glycerolfosfát) = ADP + fosfát + D-alanyl-alanyl-poly(glycerolfosfát)

EC 6.3.2.17 

Tetrahydrofolát syntáza

tetrahydrofolate synthase

ATP + tetrahydropteroyl-[γ-Glu]_n + L-glutamát = ADP + fosfát + tetrahydropteroyl-[γ-Glu]_n+1

EC 6.3.2.18 

Gama-glutamylhistamin syntáza

γ-glutamylhistamine synthase

ATP + L-glutamát + histamin = produkty ATP rozkladu + N^α-γ-L-glutamylhistamin

EC 6.3.2.19 

Ubiquitin—protein ligáza

ubiquitin—protein ligase

ATP + ubiquitin + protein lysin = AMP + difosfát + protein N-ubiquityllysin

EC 6.3.2.20 

Indolacetát-lysin syntáza

indoleacetate—lysine synthetase

ATP + (indol-3-yl)acetát + L-lysin = ADP + fosfát + 6-N-[(indole-3-yl)acetyl]-L-lysin

EC 6.3.2.21 

Ubiquitin—kalmodulin ligáza

ubiquitin—calmodulin ligase

n ATP + kalmodulin + n ubiquitin = n AMP + n difosfát + (ubiquitin)_n-kalmodulin

EC 6.3.2.22 

Difthin—amonio ligáza

diphthine—ammonia ligase

ATP + difthin + NH₃ = ADP + fosfát + difthamid

EC 6.3.2.23 

Homoglutathion syntáza

homoglutathione synthase

ATP + γ-L-glutamyl-L-cystein + β-alanin = ADP + fosfát + γ-L-glutamyl-L-cysteinyl-β-alanin

EC 6.3.2.24 

Tyrosin—arginin ligáza

tyrosine—arginine ligase

ATP + L-tyrosin + L-arginin = AMP + difosfát + L-tyrosyl-L-arginin

EC 6.3.2.25 

Tubulin—tyrosin ligáza

tubulin—tyrosine ligase

ATP + detyrosinovaný α-tubulin + L-tyrosin = α-tubulin + ADP + fosfát

EC 6.3.2.26 

N-(5-amino-5-karboxypentanoyl)-L-cysteinyl-D-valin syntáza

N-(5-amino-5-carboxypentanoyl)-L-cysteinyl-D-valine synthase

3 ATP + L-2-aminohexanedioát + L-cystein + L-valin + H₂O = 3 AMP + 3 difosfát + N-[L-5-amino-5-karboxypentanoyl]-L-cysteinyl-D-valin

EC 6.3.2.27 

Aerobaktin syntáza

aerobactin synthase

4 ATP + citrát + 2 N⁶-acetyl-N⁶-hydroxy-L-lysin + 2 H₂O = 4 ADP + 4 fosfát + aerobaktin

EC 6.3.2.28

L-aminokyselina α-ligáza

L-amino-acid α-ligase

ATP + L-aminokyselina + L-aminokyselina = ADP + fosfát + L-aminoacyl-L-aminokyselina

EC 6.3.2.29

Kyanofycin syntháza (přidávající L-aspartát)

cyanophycin synthase (L-aspartate-adding)

ATP + [L-Asp(4-L-Arg)]_n + L-Asp = ADP + fosfát + [L-Asp(4-L-Arg)]_n—L-Asp

EC 6.3.2.30

Kyanofycin syntháza (přidávající L-arginin)

cyanophycin synthase (L-arginine-adding)

ATP + [L-Asp(4-L-Arg)]_n—L-Asp + L-Arg = ADP + fosfát + [L-Asp(4-L-Arg)]_n+1

EC 6.3.3.x Cyklo ligázy

EC označení

Český název

Oficiální IUPAC název

Katalyzovaná reakce

EC 6.3.3.1

Fosforibosylformylglycinamidin cyklo ligáza

phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase 

ATP + 2-(formamido)-N¹-(5-fosfo-D-ribosyl)acetamidin = ADP + fosfát + 5-amino-1-(5- fosfo-D-ribosyl)imidazol

EC 6.3.3.2

5-formyltetrahydrofolát cyklo ligáza

5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase

ATP + 5-formyltetrahydrofolát = ADP + fosfát + 5,10-methenyltetrahydrofolát

EC 6.3.3.3

Dethiobiotin syntáza

dethiobiotin synthase

ATP + 7,8-diaminononanoát + CO₂ = ADP + fosfát + dethiobiotin

EC 6.3.3.4

(Karboxyetyl)arginin beta-laktam syntáza

(carboxyethyl)arginine β-lactam-synthase

ATP + L-N2-(2-karboxyethyl)arginin = AMP + difosfát + deoxyamidinoproclavaminát

EC 6.3.4.x Jiné C—N ligázy

EC označení

Český název

Oficiální IUPAC název

Katalyzovaná reakce

EC 6.3.4.1

GMP syntáza

GMP synthase

ATP + xanthosin 5'-fosfát + NH₃ = AMP + difosfát + GMP

EC 6.3.4.2

CTP syntáza

CTP synthase

ATP + UTP + NH₃ = ADP + fosfát + CTP

EC 6.3.4.3

Formát—tetrahydrofolát ligáza

formate—tetrahydrofolate ligase

ATP + formát + tetrahydrofolát = ADP + fosfát + 10-formyltetrahydrofolát

EC 6.3.4.4

Adenylosukcinát syntáza

adenylosuccinate synthase

GTP + IMP + L-aspartát = GDP + fosfát + N⁶-(1,2-dikarboxyethyl)-AMP

EC 6.3.4.5

Argininosukcinátsyntáza

argininosuccinate synthase

ATP + L-citrullin + L-aspartát = AMP + difosfát + (N^ω-L-arginino)sukcinát

EC 6.3.4.6

Urea karboxyláza

urea carboxylase

ATP + urea + HCO₃^- = ADP + fosfát + urea-1-karboxylát

EC 6.3.4.7

Ribózo-5-fosfát—amonio ligáza

ribose-5-phosphate—ammonia ligase

ATP + riboso-5-fosfát + NH₃ = ADP + fosfát + 5-fosforibosylamin

EC 6.3.4.8

Imidazolacetát—fosforibosyldifosfát ligáza

imidazoleacetate—phosphoribosyldiphosphate ligase

ATP + imidazole-4-acetát + 5-fosforibosyl difosfát = ADP + fosfát + 1-(5-fosforibosyl)imidazole-4-acetát + difosfát

EC 6.3.4.9

Biotin—[metylmalonyl-CoA-karboxytransferáza] ligáza

biotin—[methylmalonyl-CoA-carboxytransferase] ligase

ATP + biotin + apo-[methylmalonyl-CoA:pyruvát karboxytransferáza] = AMP + difosfát + [methylmalonyl-CoA:pyruvát karboxytransferáza]

EC 6.3.4.10

Holokarboxylát syntetáza

biotin—[propionyl-CoA-carboxylase (ATP-hydrolysing)] ligase

ATP + biotin + apo-[propionyl-CoA:karbon-dioxid ligáza (ADP tvořící)] = AMP + difosfát + [propionyl-CoA:karbon-dioxid ligáza (ADP tvořící)]

EC 6.3.4.11

Biotin—[metylkrotonoyl-CoA-karboxyláza] ligáza

biotin—[methylcrotonoyl-CoA-carboxylase] ligase

ATP + biotin + apo-[3-methylkrotonoyl-CoA:carbon-dioxid ligáza (ADP tvořící)] = AMP + difosfát + [3-methylkrotonoyl-CoA:karbon-dioxid ligáza (ADP tvořící)]

EC 6.3.4.12

Glutamát—metylamin ligáza

glutamate—methylamine ligase

ATP + L-glutamát + methylamin = ADP + fosfát + N⁵-methyl-L-glutamin

EC 6.3.4.13

Fosforibosylamin—glycin ligáza

phosphoribosylamine—glycine ligase

ATP + 5-fosfo-D-ribosylamin + glycin = ADP + fosfát + N¹-(5-fosfo-D-ribosyl)glycinamid

EC 6.3.4.14

Biotin karboxyláza

biotin carboxylase

ATP + biotin-karboxyl přenášející protein + CO₂ = ADP + fosfát + karboxybiotin-karboxyl přenášející protein

EC 6.3.4.15

Biotin—[acetyl-CoA-karboxyláza] ligáza

biotin—[acetyl-CoA-carboxylase] ligase

ATP + biotin + apo-[acetyl-CoA:karbon-dioxid ligáza (ADP tvořící)] = AMP + difosfát + [acetyl-CoA:karbon-dioxid ligáza (ADP tvořící)]

EC 6.3.4.16

Karbamoyl-fosfát syntáza

carbamoyl-phosphate synthase (ammonia)

2 ATP + NH₃ + CO₂ + H₂O = 2 ADP + fosfát + karbamoyl fosfát

EC 6.3.4.17

Formát—dihydrofolát ligáza

formate—dihydrofolate ligase

ATP + formát + dihydrofolát = ADP + fosfát + 10-formyldihydrofolát

EC 6.3.4.18

5-(karboxyamino)imidazol ribonukleotid syntáza

5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide synthase

ATP + 5-amino-1-(5-fosfo-D-ribosyl)imidazol + HCO₃^- = ADP + fosfát + 5-karboxyamino-1-(5-fosfo-D-ribosyl)imidazol

EC 6.3.5.x C—N ligázy s glutaminem jako amido-N donorem

EC označení

Český název

Oficiální IUPAC název

Katalyzovaná reakce

EC 6.3.5.1

NAD(+) syntáza (hydrolyzující glutamin)

NAD+ synthase (glutamine-hydrolysing)

ATP + deamido-NAD+ + L-glutamin + H₂O = AMP + difosfát + NAD+ + L-glutamát

EC 6.3.5.2

GMP syntáza (hydrolyzující glutamin)

GMP synthase (glutamine-hydrolysing)

ATP + xanthosin-5'- fosfát + L-glutamin + H₂O = AMP + difosfát + GMP + L-glutamát

EC 6.3.5.3

Fosforibosylformylglycinamidin syntáza

phosphoribosylformylglycinamidine synthase

ATP + N2-formyl-N1-(5-fosfo-D-ribosyl)glycinamid + L-glutamin + H₂O = ADP + fosfát + 2-(formamido)-N¹-(5-fosfo-D-ribosyl)acetamidin + L-glutamát

EC 6.3.5.4

Asparagin syntáza (hydrolyzující glutamin)

asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)

ATP + L-aspartát + L-glutamin + H₂O = AMP + difosfát + L-asparagin + L-glutamát

(1a) L-glutamin + H₂O = L-glutamát + NH₃

(1b) ATP + L-aspartát + NH₃ = AMP + difosfát + L-asparagin

EC 6.3.5.5

Karbomoyl-fosfát syntáza (hydrolyzující glutamin)

carbamoyl-phosphate synthase (glutamine-hydrolysing)

2 ATP + L-glutamin + HCO₃^- + H₂O = 2 ADP + fosfát + L-glutamát + karbamoyl fosfát

(1a) L-glutamin + H₂O = L-glutamát + NH₃

(1b) 2 ATP + HCO₃^- = 2 ADP + fosfát + karbamoyl fosfát

EC 6.3.5.6

Asparaginyl-tRNA syntáza (hydrolyzující glutamin)

asparaginyl-tRNA synthase (glutamine-hydrolysing)

ATP + aspartyl-tRNA^Asn + L-glutamin = ADP + fosfát + asparaginyl-tRNA^Asn + L-glutamát

EC 6.3.5.7

Glutaminyl-tRNA syntáza (hydrolyzující glutamin)

glutaminyl-tRNA synthase (glutamine-hydrolysing)

ATP + glutamyl-tRNA^Gln + L-glutamin = ADP + fosfát + glutaminyl-tRNA^Gln + L-glutamát

EC 6.3.5.8

Překlasifikováno na: EC 2.6.1.85

EC 6.3.5.9

Hydrogenobyrinová kyselina a,c-diamid syntáza (hydrolyzující glutamin)

hydrogenobyrinic acid a,c-diamide synthase (glutamine-hydrolysing)

2 ATP + hydrogenobyrinová kyselina + 2 L-glutamin + 2 H₂O = 2 ADP + 2 fosfát + hydrogenobyrinová kyselina a,c-diamid + 2 L-glutamát

EC 6.3.5.10

Adenosylkobyrová kyselina syntáza (hydrolyzující glutamin)

adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)

4 ATP + adenosylcobyrinová kyselina a,c-diamid + 4 L-glutamin + 4 H₂O = 4 ADP + 4 fosfát + adenosylcobyrová kyselina + 4 L-glutamát