Variabilní oblast molekuly imunoglobulinů je vysoce heterogenní oblast V zahrnující 110 N-koncových aminokyselin řetězců L a H. Přesto však mohou být na V oblastech nalezeny více či méně homologní úseky aminokyselinové sekvence. V oblasti mohou být dle tohoto kritéria rozděleny do tří základních skupin, tj. V_H skupina pro řetězce H, V_kappa pro kappa řetězce L a V_lambda pro lambda řetězce L. Tyto skupiny V oblastí jsou spojeny s odpovídající C oblastí podtříd nebo subtypů jen daného polypeptidického řetězce. Např. V_H sekvence může být nalezena pouze na řetězci H, nikdy ne na kappa nebo lambda řetězcích L. Tato V_H však může být navázána na C_H kterékoli imunoglubulinové třídy (gama, alfa, mí, delta nebo epsilon). Geny, kódující spojení V a C oblastí, jsou pravděpodobně společné.

Podskupiny oblastí V

Srovnáním sekvencí aminokyselin V oblastí kappa řetězců bylo zjištěno, že mohou být dále rozděleny do 4 podskupin, které vykazují značnou homologii. Podobné podskupiny byly také nalezeny pro oblast V řetězců H a lambda.

Hypervariabilní oblasti

Oblasti V nejsou v celém svém rozsahu stejně variabilní, ale skládají se z úseků relativně konstantní sekvence, které určují typ a podskupinu, do které daná V oblast patří, a z úseků s vysokou variabilitou, nazývaných „horká místa".

Grafickým znázorněním počtu variací v aminokyselinovém složení vázaných na danou polohu byla identifikována 3-4 místa s vysokým stupněm variability. Tato byla označena jako hypervariabilní úseky. Bylo prokázáno, že jsou to právě ty části polypeptidických řetězců, které se bezprostředně podílejí na vazbě antigenu, tvoří tedy vazebné místo protilátky. Zdá se, že řetězce L mají 3 hypervariabilní úseky, řetězce H 4 a že se mohou na vazbě antigenu podílet pouze 3 ze 4. Přibližná lokalizace hypervariabilních úseků na jednotlivých řetězcích je ilustrována na obrázku.

Další informace

· Imunoglobuliny

· Základní struktura a terminologie imunoglobulinů

o Typy lehkých řetězců

o Třídy těžkých řetězců

o Vlastnosti lidských imunoglobulinů

o Podtřídy polypeptidových řetězců

o Allotypické (allelické) formy těžkých a lehkých řetězců

· Sekreční komponenta a řetězec J

· Sacharidové složky imunoglobulinů

· Imunoglobuliny: biologické aktivity

· Idiotypy