Hybridizace in situ s vysokým rozlišením (fiber FISH) je postup molekulární cytogenetiky směřující ke zvýšení citlivosti fluorescenční hybridizace in situ (FISH). Jedná se o metodu využívající techniky extrakce DNA z jádra. DNA vytváří v jádře kličky uspořádané ve formě kruhů kolem matrix (tzv. halo preparace, halo like structure, fiber FISH). Signály alfoidních a kosmidových sond se objevují jako korálky navlečené na šňůře a vícebarevnou hybridizací je pak možné určit relativní polohu jednotlivých sond k sobě navzájem. Rezoluční rozpětí je okolo 10 - 200 kb, konfigurační mapa může být získána z 5 - 10 buněk a citlivost metody umožňuje studovat individuální překrývání použitých sond v jednotlivých oblastech chromosomů.

Pro vytvoření halo preparační techniky se používají extrahovaná jádra fibroblastů, kultivovaných na mikroskopických krycích sklech. Extrakce se provádí detergenty a roztoky s vysokým obsahem solí. Chromatin může být uvolněn i z rutinně sklízených PHA stimulovaných lymfocytů periferní krve fixovaných metanolem a kyselinou octovou. Technika fiberFISH nachází širší uplatnění především při mapování genů, v některých případech DNA diagnostiky (detekce mikrodelecí a malých duplikací ) a rovněž ve výzkumu organizace a funkce chromatinu v jádrech.

Další informace

· Molekulární cytogenetika

· Hybridizace in situ

· Hybridizace in situ fluorescenční (FISH)

· Hybridizace komparativní genomová (CGH)

· Hybridizace komparativní genomová: matrix CGH

· Hybridizace: mBAND

· Hybridizace: mFISH

· Hybridizace: mikro-FISH

· Hydrofilní a hydrofobní

· Klinická genetika: základní pojmy

· Klinická genetika

· Metody molekulárně genetické

Kyra Michalová